富栄養化が起きると水域や水系において過剰な栄養物の供給が起きてしまい、藻類の増殖などの現象を引き起こします。また藻類が原因で、水中の溶存酸素量が減少することにより、魚や水生生物の生息環境や水質を悪化させ、酸素不足による生態系の破壊や大量死が発生するリスクが上がります。水処理設備では、栄養物の除去や処理を適切に行い、排水の質を改善させる必要があります。